2025/2026

Il corso si propone di consolidare le conoscenze di base riguardanti le banche dati genomiche e le nuove tecnologie di sequenziamento. Verranno inoltre fornite conoscenze di base dei linguaggi di programmazione necessari per le principali analisi bioinformatiche affrontate durante il corso. Alla fine del corso, gli studenti saranno in grado di applicare le loro competenze per affrontare e risolvere problemi complessi nel campo della bioinformatica, come l'analisi e l'interpretazione di grandi dataset genomici. Saranno quindi in grado di pianificare un esperimento di sequenziamento genomico e di utilizzare pipeline bioinformatiche applicabili in svariati contesti di ricerca scientifica. Gli studenti acquisiranno la capacità di integrare conoscenze interdisciplinari provenienti da bioinformatica, genetica e biologia molecolare per gestire e risolvere problemi multidimensionali e complessi. Saranno in grado di affrontare la complessità dei dati biologici e delle tecnologie informatiche, adattando e ottimizzando le metodologie per rispondere a nuove e complesse sfide. Gli studenti saranno in grado di comunicare con un linguaggio tecnico e scientifico le metodologie scelte, I risultati e le loro conclusioni a interlocutori specialisti e non specialisti, attraverso documentazione scientifica, articoli accademici e presentazioni orali. Il corso comprenderà lezioni frontali teoriche ed esercitazioni pratiche durante le quali gli studenti acquisiranno le competenze necessarie per proseguire con un apprendimento autonomo e continuo nel campo della bioinformatica. Dovranno essere in grado di identificare le proprie esigenze formative, colmare eventuali lacune nelle loro conoscenze e aggiornarsi sulle nuove tecnologie e metodologie emergenti.

Sono richieste conoscenze di base dei sistemi biologici, procariotici ed eucariotici, la struttura delle principali molecole biologiche quali DNA, RNA e proteine, nozioni genetica e biologia molecolare e di informatica.

L'insegnamento "Bioinformatics" si pone l’obiettivo di fornire agli studenti della laurea magistrale e ai dottorandi le competenze di base necessarie per avanzate tecniche computazionali nell’analisi delle macromolecole biologiche. In particolare, gli studenti verranno guidati attraverso un excursus storico delle tecniche genomiche, dalle prime sperimentazioni alla tecnologie più all’avanguardia, acquisendo durante il percorso la capacità di interpellare le principali banche dati genomiche, di utilizzare i vari software per l’allineamento delle sequenze nucleotidiche e proteiche, per l'analisi genomica e trascrittomica. Inoltre, verranno fornite nozioni di base di linguaggi di programmazione e dell'architettura dei sistemi informatici che consentiranno agli studenti di pianificare in maniera efficiente e performante un'intera pipeline di analisi.
Al termine del corso lo studente sarà in grado di:
• Pianificare e sviluppare un intero esperimento di genomica computazionale.
• Discernere fra le varie tecniche di sequenziamento.
• Essere in grado di interpellare le banche dati genomiche e di letteratura scientifica.
• Allineare sequenze genetiche ed evidenziare le principali differenze.
• Assemblare interi genomi, valutarne l’espressione genica e identificare tutti gli organismi presenti in una matrice ambientale.

Tutto il materiale necessario per lo studio della materia verrà fornito dal docente durante il corso e sarà disponibile sulla pagina Moodle.

Le attività didattiche del corso Bioinformatics prevedono lezioni teoriche svolte dal docente intervallate da esercitazioni pratiche insieme agli studenti.
In ottemperanza alle disposizaioni di Ateneo e dei DPCM, le lezioni verrano svolte frontalmente con possibità di seguire da remoto.

La frequenza alle lezioni non è obbligatoria ma fortemente consigliata.

L'esame è orale e individuale e prevede domande inerenti il programma del corso. In particolare, lo studente deve dimostrare di aver appreso le conoscenze di base e aver sviluppato una capacità di senso critico e logico nella stesura di un esperimento di genomica e di avere padronanza dell'argomento e della terminologia. Nella valutazione finale verrà tenuto conto del livello di partecipazione durante l'intero corso, della presenza e partecipazione alle esercitazioni in aula e delle esercitazioni individuali.

    SILVIA TURCO