| Data |
Inizio |
Fine |
Sintesi della lezione |
Luogo |
| 26/02/2024 |
11:00 |
13:00 |
Bioinformatics introduction and application examples. Molecular biology
pills: Prokaryotes and Eukaryotes, genome size, DNA and chromatin
structure, the RNA world, the central dogma, RNA interference,
epigenetics. |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 28/02/2024 |
11:00 |
13:00 |
Databases: history, sequences and structures, primary, secondary,
composite. NCBI, GenBank. |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 06/03/2024 |
11:00 |
13:00 |
Databases: ENA, BLAST, Alignment, Pubmed. Literature Tools:
Mendeley, Scholar, Scopus. |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 07/03/2024 |
16:00 |
18:00 |
Databases: Local and global alignment: BLAST Vs Emboss needle |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 13/03/2024 |
11:00 |
13:00 |
Databases: EBI tools. |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 14/03/2024 |
16:00 |
18:00 |
Databases: Exercises |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 20/03/2024 |
11:00 |
13:00 |
Databases: Exercises |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 27/03/2024 |
11:00 |
18:00 |
Next generation sequencing technologies: Roche 454, Ion Torrent,
Illumina, Solid. |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 03/04/2024 |
11:00 |
13:00 |
Third generation sequencing technologies PacBio, Nanopore. |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 04/04/2024 |
16:00 |
18:00 |
Sanger sequencing results visualization tool: FinchTV |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 10/04/2024 |
11:00 |
13:00 |
Sanger sequencing results visualization tool: FinchTV exercises |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 11/04/2024 |
16:00 |
18:00 |
Terminology and definitions: Coverage, Paired-end sequencing |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 24/04/2024 |
11:00 |
13:00 |
Alignment, Phred score |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 15/05/2024 |
11:00 |
13:00 |
FASTA format, FASTQ file, SAM and BAM, VCF file, GFF file, Barcoding,
Trimming |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 16/05/2024 |
16:00 |
18:00 |
FastQC, Quality check, Assembly. |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 22/05/2024 |
11:00 |
13:00 |
Introduction to Unix-Linux environment |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 23/05/2024 |
16:00 |
18:00 |
Introduction to Unix-Linux environment - part II |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 29/05/2024 |
10:00 |
13:00 |
Unix-Bash basic command lines |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 30/05/2024 |
16:00 |
18:00 |
Unix-Bash basic command lines and practise |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
| 06/06/2024 |
14:00 |
18:00 |
De novo hybrid assembly of a bacterial genome |
Non disponibile |
Non disponibile |
Non disponibile |
