119928 - Plant genomes and chromosome manipulations

DAFNE - Plant Biotechnology for Food and Global Health

Docente: Carla CEOLONI


Lezioni registrate
Data Inizio Fine Sintesi della lezione Luogo
05/10/2023 14:00 16:00 Metodi di analisi di cromatina, cromosomi e genomi Non disponibile Non disponibile Non disponibile
10/10/2023 11:00 13:00 Dimensioni dei genomi procariotici e eucariotici; il paradosso del valore C Non disponibile Non disponibile Non disponibile
12/10/2023 14:00 16:00 Sequenze componenti i genomi eucariotici: quadro generale e microsatelliti Non disponibile Non disponibile Non disponibile
17/10/2023 11:00 13:00 Elementi trasponibili: le prime evidenze di Barbara McClintock; le classi (tipi a DNA e a RNA), relativa abbondanza in vari organismi, meccanismi di trasposizione Non disponibile Non disponibile Non disponibile
19/10/2023 14:00 16:00 Elementi trasponibili (ET): organizzazione "nested"; meccanismi di crossing-over ineguale e ricombinazione illegittime e loro conseguenze su dmensioni del genoma ET-dipendenti Non disponibile Non disponibile Non disponibile
24/10/2023 11:00 13:00 I geni eucariotici - la loro struttura, con particolare riferimento agli introni e loro funzioni; la duplicazione genica: "duplicate and diverge" Non disponibile Non disponibile Non disponibile
26/10/2023 14:00 16:00 Famiglie multigeneiche e super-famiglie geniche: gli istoni, le globine umane, i geni per resistenza a patogeni nelle piante. Non disponibile Non disponibile Non disponibile
31/10/2023 11:00 13:00 La compartimentazione del genoma: le isocore, regioni gene-rich e gene-poor; distribuzione non omogenea della ricombinazione lungo il cromosoma, confronto tra mappe genetiche e fisiche, hot e cold spots Non disponibile Non disponibile Non disponibile
09/11/2023 14:00 16:00 Distribuzione della ricombinazione nel cromosoma 3B di frumento, nella regione tra i geni a1 e sh2 in mais e nel genoma di frumento duro; correlazione tra frequenza di ricombinazione e stato di condensazione della cromatina Non disponibile Non disponibile Non disponibile
21/11/2023 11:00 13:00 Genomica comparativa: sintenia e colinearità intergenomica/interspecifica; concetti di ortologia, omeologia; interruzioni della sintenia/colinearità: riarrangiamenti cromosomici Non disponibile Non disponibile Non disponibile
23/11/2023 14:00 17:00 Genomica comparativa: dalla macro- alla microcolinearità, ovvero dal confronto intergenomico basato su mappe genetiche vs. quello basato sul sequenziamento; l'evoluzione del genoma/la speciazione delle Gramineae tramite riarrangiamenti; confronto genoma umano e altri mammiferi Non disponibile Non disponibile Non disponibile
28/11/2023 11:00 13:30 Evoluzione dei genomi delle Graminaceae basato sul sequenziamento, confronto dei genomi di frumento e Brachypodium. La poliploidia: importanza per l'evoluzione delle Angiosperme; il caso di studio Amborella trichopoda; i paleo-poliploidi; la frequenza del fenomeno; i tipi di poliploidi: auto- e allo-poliploidi; meccanismi di insorgenza spontanea della poliploidia: formazione di gameti non-ridotti Non disponibile Non disponibile Non disponibile
30/11/2023 14:00 16:30 Meccanismi di accumulo di variabilità genetica in auto- e allo-poliploidi; le origine dei frumenti poliploidi (visione classica e recente); il ruolo della poliploidizzazione nel genere Brassica; meccanismi genetici e citologici alla base del successo evolutivo dei poliploidi a riproduzione sessuata: la regolazione della meiosi Non disponibile Non disponibile Non disponibile
05/12/2023 11:00 16:30 Esercitazione di laboratorio: estrazione di DNA estratto da foglie giovanili di piente di frumento Non disponibile Non disponibile Non disponibile
07/12/2023 12:00 17:00 Esercitazione di laboratorio: allestimento di un saggio PCR per l'analisi del polimorfismo in un set di genotipi di frumento (DNA estratto in precedenza) per una sequenza microsatellite (CFA2240) Non disponibile Non disponibile Non disponibile
12/12/2023 11:00 13:00 Fenomeni rivoluzionari (short-term) e evolutivi (long-term) di adattamento alla condizione poliploide: uso e analisi di poliploidi sintetici; la perdita di sequenze; il "genome downsizing" Non disponibile Non disponibile Non disponibile
14/12/2023 14:00 16:30 Modificazioni epigenetiche conseguenti alla poliploidizzazione: la metilazione del DNA e degli istoni; l'acetilazione degli istoni, il chromatin remodelling; metilazione del DNA mediata da RNA; piccoli RNA e miRNA nella risposta a stress di varia natura; il chromatin remodelling nel controllo dell'appaiamento meiotico in allopoliploidi Non disponibile Non disponibile Non disponibile
19/12/2023 11:00 13:00 Manipolazioni dei genomi vegetali a fini applicativi - le motivazioni e gli approcci sostenibili di intervento per fronteggiare le sfide produttive: il ricorso alle specie selvatiche affini; i gene pools primari,secondari e terziari e le possibilità di accedere alla loro variabilità genetica; l'uso di mutanti meiotici (produttori di gameti 2n) di specie selvatiche di Solanum e Medicago (diploidi) per trasferire geni utili in patata ed erba medica coltivate (autopoliploidi) Non disponibile Non disponibile Non disponibile
21/12/2023 14:00 17:00 Il trasferimento genico interspecifico in allopoliploidi coltivati (Triticum spp.): dalla produzione di anfiploidi a linee di addizione e sostituzione di interi cromosomi o bracci cromosomici. Ingegneria cromosomica in frumento: l'uso di mutanti ph per indurre ricombinazione tra cromosomi omeologhi; esperienze sperimentali: il caso di studio del trasferimento del gene Pm13 per resistenza all'oidio da Aegilops longissima in frumento tenero e duro; di geni per proteine di riserva da frumento tenero (genoma D) a duro; di vari geni per resistenza a stress biotici e abiotici da specie del genere Thinopyrum; trasferimenti "multipli". Non disponibile Non disponibile Non disponibile